Dès la première ouverture, l'application crée un compte anonyme, sans adresse e-mail : il contient un pseudo attribué automatiquement (que vous pouvez modifier), votre département si vous le renseignez et les ammonites enregistrées pour les classements. Le reste de la progression (dictionnaire personnel, série de jours, préférences) est conservé sur votre appareil.
Si vous choisissez d'associer un compte Google, s'y ajoutent l'adresse e-mail du compte Google (identification) ainsi que le nom et la photo de profil transmis par Google lors de la connexion ; la photo s'affiche uniquement dans vos Réglages.
Si vous souscrivez un abonnement Essentiel ou Premium, l'état de l'abonnement (formule, statut, date d'échéance) est enregistré et rattaché à votre compte. Le paiement est traité par Google Play : aucune coordonnée bancaire ne nous est transmise.
Si vous parrainez un ami ou saisissez son code, le lien entre les deux comptes, la date et la récompense éventuelle sont enregistrés, pour attribuer la semaine offerte et la récompense, et pour pouvoir l'annuler en cas d'abus.
Pour la mesure d'audience, sont collectés des événements de navigation et de jeu (notamment écrans ouverts, onglets touchés, grilles ouvertes et temps passé, mode et niveau joués, aides utilisées, étapes de la Première plongée, ouverture de la boutique et achats, partage et parrainage, réglage des rappels, appui sur « Enregistrer le fond d'écran », appui sur le cœur de soutien et ouverture de la page Soutenir du site), rattachés à un identifiant aléatoire propre à l'installation, jamais relié à votre compte. Si vous acceptez les statistiques Google Analytics, ces mêmes événements lui sont aussi transmis. Aucun mot trouvé, aucun e-mail et aucun identifiant publicitaire ne sont transmis.
Pour le classement départemental, l'application estime votre département à la première ouverture à partir de votre adresse IP, auprès du service ipapi.co. Si vous touchez « Détecter ma position » dans les Réglages et l'autorisez, la position approximative de l'appareil est envoyée au service public geo.api.gouv.fr pour trouver la commune correspondante. Seul le numéro de département est conservé : ni l'adresse IP ni la position ne sont enregistrées par Motlécule, et le département se modifie à tout moment dans les Réglages.
En cas d'erreur ou de plantage, un rapport technique est envoyé à Sentry (description de l'erreur, écran concerné, modèle et version de l'appareil et de l'application, temps de chargement de certains écrans). Il est rattaché à l'identifiant technique de votre compte, sans e-mail, ni pseudo, ni mot joué, pour pouvoir faire le lien avec une demande de support.